Elément nutritif indispensable au monde vivant, le phosphore quand il se trouve en excès peut aussi être à l’origine de l’eutrophisation des milieux aquatiques en permettant un développement surabondant de végétation. Pour empêcher l’eutrophisation, il faut réduire l’entrainement de phosphore dans l’eau quelle que soit son origine (eaux usées urbaines et industrielles, élevages et sols cultivés ). Prévenir l’érosion et intercepter les ruissellements limitent fortement le transfert du phosphore fixé aux particules de sol.

Contrairement au nitrate, le phosphore est très peu mobile en solution et ne migre pas en profondeur dans le sol. La couverture végétale des sols en hiver, les bandes enherbées ou les haies en rupture de pente et au bord des cours d’eau sont des moyens très efficaces d’empêcher le phosphore de rejoindre les milieux aquatiques. Réglementer l’apport de phosphore d’origine animale et minérale sur les sols agricoles n’aura pas d’effet direct sur  l’eutrophisation.

L’apport de phosphates dans les engrais minéraux a diminué de 70% en 20 ans et représente en 2004-05 moins de 12 kg de phosphate par ha dans les ventes aux agriculteurs bretons. Parallèlement l’incorporation de phosphates dans l’alimentation animale est en baisse. C’est donc l’ensemble des apports qui diminue permettant un réajustement très important du bilan au niveau des sols agricoles. Cette tendance devrait se poursuivre. En 2004, les engrais apportent moins de 20% de l’apport de phosphore aux sols. Ils constituent un complément utile sur les surfaces ou l’épandage de lisiers et fumiers est interdit et sur certaines cultures exigeantes qui ont besoin d’un engrais starter localisé au moment du semis ou d’une forme minérale directement disponible.